Het markante hoofdgebouw is van oudsher een belangrijke blikvanger op het Annapark. Het statige gebouw uit het begin van de twintigste eeuw kenmerkt zich door een symmetrisch ontwerp en elementen uit de klassieke bouwkunst en is een kopie van een gebouw dat staat in het plaatsje Melle in Belgiƫ.
Vroeger waren hier het kloostergedeelte en de bestuurlijke diensten gevestigd. Ook straks is dit Rijksmonument, met ruimte voor onder andere een hotel, nog altijd het herkenningspunt gelegen aan de entree van het Annapark. Het Hoofdgebouw wordt onderworpen aan een grootschalige restauratie welke eind 2020 zal worden afgerond.